石莫制定下了计算机硬件的发展方向后，继续安排其他的研发事项。
2012实验室计算机系统研究所，主要从事图形界面系统、多媒体、计算机科学基础等领域的研究，致力于推动计算机科学前沿发展，着眼下一代革命性技术的研究，助力公司实现长远发展战略。这个研究所由姚期知负责。
姚期知，计算机学家，1946年出生于中国上海，1967年姚期智获得台湾大学物理学士学位；1972年获得哈佛大学物理博士学位；1975年获得伊利诺依大学计算机科学博士学位，之后先后在美国麻省理工学院数学系、斯坦福大学计算机系、加州大学伯克利分校计算机系任助理教授、教授；2000年图灵奖获得者，是美国国家科学院院士、美国艺术与科学学院院士、中国科学院院士、港科院创院院士。
姚期知的研究方向包括计算理论及其在密码学和量子计算中的应用，最先提出量子通信复杂性，提出分布式量子计算模式，后来成为分布式量子算法和量子通讯协议安全性的基础。
石莫任命好计算机系统研究所的负责人，姚期知就向石莫问道“老板，这个图形界面系统是美国施乐公司设计的那种系统吗？”
pc上的第一个图形界面系统是xeroxalto，其于1973年被施乐公司所设计，施乐的工程师在发明鼠标的时候，顺便设计了配合鼠标使用的图形操作系统，但该系统并未商用，主要用于大学和研究机构。
现在it行业主要用图形界面系统还很少。苹果公司的第一个图形界面系统是1984年发布的。微软的dows10系统要到1985年秋天才会正式发布，之前用的一直是dos系统。
石莫说道“是的，因为现在的unix系统使用门槛太高了，电脑的每一个操作都必须下指令，靠输入指令来运行程序，如此难用，这会制约个人电脑的市场化普及。计算机其实可以更好用，可以通过点击鼠标来完成大部分的操作。未来必然是操作简单快捷的图形界面系统的时代，因此我们要提前布局，现在就组建团队开始设计图形操作系统，到82年时要配合我们的cpu芯片，研制出一台划时代的个人电脑来，开启操作系统和应用软件的革命。”
“这个操作系统要完整地集成桌面和应用程序以及图形界面，相比xeroxalto系统，我们还要开发一些新技术，比如，基于窗口用图标的ui，窗口可以被鼠标移动，可以使用鼠标拖动文件和目录以完成文件的py和ove，可以执行多个程序并在各个程序之间自由切换。”石莫怕姚期智做的跟xeroxalto系统一样简单，这些技术在xeroxalto上都是没有的，因此提示说道。
“好的，老板，我知道如何做了。”姚期智点头应声道。
石莫继续说道“期智，除了操作系统，你还要做支撑软件，包括一系列的基本工具，比如编程语言、编译器、数据库管理、存储器格式化、文件系统管理、用户身份验证、驱动管理、网络连接等方面的工具。”
支撑软件是支撑各种软件的开发与维护的软件，又称为软件开发环境（sde）。软件产品的研发是研发人员通过编写特定计算机编程语言，然后利用该语言环境下的一系列工具，手动或自动对其编写的代码进行编译、执行、调试、集成和测试的过程。
姚期智点了点头，表示自己了解。
……
2102实验室计算机应用软件研究所，主要是研发办公软件、多媒体软件、分析软件、商务软件、协作软件等面向用户的应用软件。
应用软件是为满足用户不同领域、不同问题的应用需求而提供的那部分软件，它可以拓宽计算机系统的应用领域，放大硬件的功能，这些产品往往是用户最有感知的。这个研究所的负责人为刘炯郎。
刘炯郎，生于gd省广州市，少年时期长于葡属澳门。留美顺利取得麻省理工学院计算机硕士、博士。之后曾经执教麻省理工学院、伊利诺大学、国立清华大学等，并担任伊利诺大学香槟校区助理副校长一职。